1）法律合规问题

一旦使用区块链，而不是由第三方机构签署服务，金融机构或者企业可能会面临复杂的法律和合规问题。区块链的一些基本特征，包括该软件的地位、去中心化的结构及其开源软件的开发过程都给金融机构的管理带来了潜在的风险。区块链技术使得数字资产的发行、清算、结算成本大大降低，但也面临着诸多法律法规的问题。

2）技术不成熟的问题

目前分布式账本的技术仍旧不成熟，并且未经更多行业应用证明。例如，区块链就存在着固有的规模限制，并且其无缝整合进金融市场环境的底层基础设施还有很多工作要做。智能合约技术使得复杂的金融合约和金融衍生品成为可能，会大大降低合约构建的成本和人为失误造成的影响，但是智能合约技术也有其局限性，例如，全局维护可能造成很多资源的浪费，另外一些无法预审查的合约将也会造成很多麻烦，这些都需要更多的探索。

3）路线和标准不统一的问题

大型银行和服务提供商虽然形成一股区块链热，但技术路线较多，可能出现的情况是：不同机构或联盟各自获得了的不同区块链发展，但相互分割的不同类型的区块链又成为一个个“信息孤链”。区块链技术解决方案是基于分布式网络的，这意味着它不会被哪一个组织或者机构控制，许多机构都可以整合它，不过将这种创新技术整合进现有的金融系统中却是一个极具挑战性的工作。区块链又是个系统工程，其技术的潜力只有通过市场参与者、监管者和技术专家之间的共同合作才能最终实现，协调难度很大，可能需要更长的时间。

4）利益格局问题

去中心化意味着现有格局的改变，但这些中介机构都是大公司，具有巨大利益，他们没有主动变革的内在动力。

5）公共网络可持续维护的问题

区块链基本是开源的，大家共同参与软件的开发和维护，但没有一个人在法律上有义务必须这样做。例如，如果比特币的相关操作或价值出现危机，就没有相对的财务系统或支付专家去参与来应对危机。金融市场基础设施是为所有用户服务的，一旦它停止了工作，用户的支付或中央票据交换所都将会瘫痪。即使银行和其他金融机构能够通过创建私有区块链和雇用软件程序员来解决上述一些操作性的问题并保证系统的运行，受托责任的问题总是要在其中发挥作用。区块链数据记录的不可逆性是部署区块链的一个障碍，“它很难停下来”，否则会出现分叉。要克服这个障碍，就必须要由运行区块链网络的参与者达成一致的机制来解决。这些运营维护的复杂度与私营机构的商业利益有些格格不入。

6）区块链滥用和泛用的问题

正确使用区块链来维护其作为价值交易网络的质量与信誉非常关键。一些天然合适的区块链应用场景却可能造成它声名狼藉。比如，博彩就是很适合开发区块链应用的场景，但也可能给它带来坏名声。